目前，本课程面向食品科技学院、现代科技学院、农村发展学院等多个学院的食品科学与工程、食品质量与安全、食品生物技术等多个专业开设，每个学年都有10～15个班次。
在课程建设中，我们在教学方法和教学手段方面做了多方面的工作，取得了显著的成效。
1.“培养创新思维”的教学模式探索与实践
食品微生物以往传统的教学方法大多是教师在课堂上不停的讲授，学生不停地记笔记；授课后或考试前，学生背书、背笔记；课程结束后，学生掌握的知识所剩无几。因此，本课程组各位教师对教学方法进行了积极的改革。
Ⅰ采用情景式教学，激发学生的学习兴趣。课堂上，教师经常给学生创设问题情境，将教学内容以学生感兴趣的问题提出，如：“食品微生物的种类有哪些，形态如何，怎样识别和命名；如何利用有益菌，为人类提供营养丰富、有益健康的食品；如何控制有害菌，保证食品的安全性……”。这些与专业内容紧密相关的问题，激发了学生对本专业的求知欲和好奇心，使学生在课堂上注意力集中，处于最佳的“感受态”。
Ⅱ运用启发式教学，从单向主体制传授转变为双向主体制共同活动。
Ⅲ采用研讨式教学，培养学生独立思考、综合分析和解决问题的能力。教师在讲授完阶段性教学内容之后，给学生布置一个讨论专题，作为该阶段性教学内容的拓宽和深化，要求学生课后查阅资料完成；然后进行课堂专题讨论，让学生上台演讲，各抒己见；最后由教师归纳总结。该教学方法的实施，不仅可使学生增长知识，开阔视野；而且培养了学生独立思考、综合分析和解决问题的能力。
Ⅳ运用比较法教学。针对食品微生物学理论丰富、应用性强、概念繁多、类群庞大之特点，进行比较法教学。例如：原核生物与真核生物的比较；食品微生物不同类群（细菌、放线菌、霉菌、酵母菌、病毒）的比较；微生物营养类型的比较；微生物呼吸类型的比较；微生物发酵类型的比较；微生物对营养物质跨膜运输机制的比较；食品微生物菌种保藏方法的比较；细菌生长曲线与病毒生长曲线的比较；细菌素与抗生素的比较；微生态制剂与菌苗、疫苗的比较；内毒素、外毒素、类毒素的比较……加深了学生对知识的理解和掌握，使概念明晰化、理论广延化、点状知识连续化、平面知识立体化。
2.应用现代化教学手段提高教学效果。
食品微生物学是一门理论与实践紧密结合的学科，同时，又是一门发展迅猛、日新月异的学科。为此，增加教学的直观性、融入最新的知识点而采用现代化的教学手段，势在必行。近年来，本课题组各位教师精心研制出内容丰富、生动形象、条理清晰、新颖时尚的“食品微生物学”CAI多媒体课件，使食品微生物学的教学效果和教学质量迈上一个新台阶。
3.探究型、应用型实践教学模式
(1)提供学生多动手操作的机会。食品微生物学实验的特点是准备工作繁多，为此，我们给学生合理的安排了实验的准备工作，增加了学生动手操作的机会，有利于学生系统地掌握食品微生物学实验的技术方法和操作技能。
(2)在实验教学的基础上，设计综合实习，使学生的微生物操作技能在各相关专业领域中得以应用和锻炼。通过实验教学和教学实习，锻炼学生理论联系实际的能力，增强学生的思考、分析能力。
(3）研究生导师吸收本科生进入科研实验室，鼓励学生进行探究性科研活动，使之参与教师的科研课题的研究，充分发挥学生的主观能动性，由教师个别地指导学生开展项目研究，带领学生参与课题的调研、研讨、论文写作等，以培养学生的实践能力，锻炼学生的个人素质。
(4）开放教学实验室，积极支持学生开展自主性科研活动。教师发挥引导作用，解答疑难问题，邀请国内外相关领域的专家进行学术讲座，引导学生参与并开展学术交流，提高分析、综合、研究、解决问题的能力。
(5）定期组织学生进行专业知识和实验技能讨论，增强学生的自主性、创造性及自我完善的能力。
(6) 加强校内教学生产实习基地建设。近年来，本课题组队对校内教学生产实习基地进行了设施与设备的工艺技术的配套改造，形成了二条中试生产作业线，其中一条为发酵食品中试生产作业线，为食品微生物学课程及其他专业课程的教学生产实习创造了条件
4.改革实验课考试方式。首先，加大了食品微生物学期末考试试卷中实验题的比重（占实验总成绩的40%）；其次，对于设计性、综合性实验，根据实验报告中取得的数据结果和理论分析进行成绩评定（占实验总成绩的30%）；而对于操作性强的简单实验，则以操作技能为依据给出成绩（占实验总成绩的20%）；另外，学生的实验态度、劳动观念、协作精神、考勤值日、平时提问、课堂讨论等也纳入实验课成绩考核的范围（占实验总成绩的10%），使实践性教学环节得到加强。
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